TOEFLは過去2年間で一番良いスコアを出せばOKです。過去に何度受けたかは記載されないので仮に20回受けていたとしてもBest Scoreを１つだけ送れば良いはずです。スコア欄が２つあるのは何故か？ と大学に問い合わせてみてはどうでしょう?
